Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a9P28571 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a9P28571 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms