Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Etv4P28322 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Etv4P28322 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Etv4P28322 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms