Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb3P28231 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms