Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pde6aP27664 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms