Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd40lgP27548 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms