Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RdxP26043 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RdxP26043 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RdxP26043 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RdxP26043 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RdxP26043 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RdxP26043 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RdxP26043 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RdxP26043 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RdxP26043 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RdxP26043 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms