Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd12P23812 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms