Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PparaP23204 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PparaP23204 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PparaP23204 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PparaP23204 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PparaP23204 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PparaP23204 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PparaP23204 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PparaP23204 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PparaP23204 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PparaP23204 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PparaP23204 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PparaP23204 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PparaP23204 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PparaP23204 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PparaP23204 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms