Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd3eP22646 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd3eP22646 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms