Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ms4a2P20490 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ms4a2P20490 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms