Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcaP20444 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms