Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P20040 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P20040 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P20040 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P20040 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P20040 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P20040 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P20040 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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