Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NefhP19246 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NefhP19246 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NefhP19246 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NefhP19246 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NefhP19246 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NefhP19246 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NefhP19246 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NefhP19246 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NefhP19246 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NefhP19246 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms