Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csn1s1P19228 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csn1s1P19228 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms