Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnnc1P19123 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnnc1P19123 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms