Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RargP18911 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RargP18911 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RargP18911 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RargP18911 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RargP18911 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RargP18911 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RargP18911 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RargP18911 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RargP18911 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms