Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P18530 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P18530 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P18530 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18530 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18530 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18530 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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