Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18528 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18528 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18528 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18528 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18528 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P18528 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P18528 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P18528 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms