Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P18526 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18526 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18526 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18526 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18526 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P18526 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P18526 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P18526 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P18526 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P18526 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P18526 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P18526 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18526 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P18526 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18526 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18526 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18526 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P18526 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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