Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtpraP18052 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtpraP18052 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms