Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PcnaP17918 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PcnaP17918 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PcnaP17918 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms