Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sptan1P16546 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sptan1P16546 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms