Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme1P15532 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme1P15532 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms