Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd5P13379 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd5P13379 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd5P13379 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms