Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms