Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itga5P11688 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga5P11688 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms