Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nid1P10493 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nid1P10493 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms