Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd8bP10300 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd8bP10300 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms