Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Amd1P0DMN7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Amd1P0DMN7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms