Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifna9P09235 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms