Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxa6P09092 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxa6P09092 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms