Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd3P09027 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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