Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NeflP08551 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NeflP08551 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NeflP08551 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
NeflP08551 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NeflP08551 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NeflP08551 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NeflP08551 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NeflP08551 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NeflP08551 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NeflP08551 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NeflP08551 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms