Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Spta1P08032 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Spta1P08032 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Spta1P08032 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms