Protein–RNA interactions for Protein: P06909

Cfh, Complement factor H, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfhP06909 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CfhP06909 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CfhP06909 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CfhP06909 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CfhP06909 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CfhP06909 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CfhP06909 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CfhP06909 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CfhP06909 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CfhP06909 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CfhP06909 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CfhP06909 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CfhP06909 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CfhP06909 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CfhP06909 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CfhP06909 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CfhP06909 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CfhP06909 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CfhP06909 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CfhP06909 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CfhP06909 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CfhP06909 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms