Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P04940 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P04940 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P04940 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P04940 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P04940 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04940 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04940 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04940 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P04940 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P04940 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P04940 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms