Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01803 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01803 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01803 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01803 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01803 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01803 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms