Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01797 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01797 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01797 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01797 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01797 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01797 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01797 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01797 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms