Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01669 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01669 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01669 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01669 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01669 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01669 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01669 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms