Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01662 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01662 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01662 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01662 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01662 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01662 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01662 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01662 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01662 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01662 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01662 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01662 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01662 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms