Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01661 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01661 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01661 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01661 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01661 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01661 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01661 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01661 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01661 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01661 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01661 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01661 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms