Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mtatp6P00848 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms