Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Abl1P00520 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abl1P00520 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms