Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Casp8O89110 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casp8O89110 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casp8O89110 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Casp8O89110 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Casp8O89110 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Casp8O89110 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms