Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Robo1O89026 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Robo1O89026 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Robo1O89026 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms