Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tcn2O88968 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tcn2O88968 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms