Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apaf1O88879 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apaf1O88879 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms