Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hcn2O88703 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hcn2O88703 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms