Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BlmO88700 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BlmO88700 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BlmO88700 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BlmO88700 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BlmO88700 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BlmO88700 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BlmO88700 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BlmO88700 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BlmO88700 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BlmO88700 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BlmO88700 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BlmO88700 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BlmO88700 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
BlmO88700 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BlmO88700 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BlmO88700 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BlmO88700 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BlmO88700 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BlmO88700 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BlmO88700 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BlmO88700 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BlmO88700 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BlmO88700 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BlmO88700 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BlmO88700 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BlmO88700 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BlmO88700 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.24
BlmO88700 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BlmO88700 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms