Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema3fO88632 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema3fO88632 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms